由于織田軍的本陣、側翼皆遭到突襲，以及織田軍總大將織田信長因右腿中箭墜馬，在赤母衣眾的拼死掩護下退往尾張中部重鎮末森城進行救治。

    隨著六角軍的不戰而逃，以及織田信長的退出戰場，使得織田軍各部頓時陷入了群龍無首的狀態。

    野口政利（平手政秀之弟）、平手久秀（平手政秀之子）、堀尾泰晴、山內盛豐、前野時之、平野宗房等將也是無心與上杉軍繼續交鋒。他們可不愿將自己的小命丟在這巖崎原上，便紛紛率馬廻眾逃離戰場，以免被上杉軍討取。

    可此時的上杉軍經過拼死血戰已經取得優勢，并在總大將八條定繁的號令之下全線發起反擊，直撲織田軍各部后撤的軍勢。

    只見越來越多的織田軍喪失戰意，各自丟盔棄甲，四散而逃。

    柴田勝家、森可成、池田恒興、下方貞清等織田家猛將們倒是反應不慢，很快就判斷出己方已然敗北，不再戀戰，當即率本部軍勢向巖崎原的西北方進行突圍。

    大風陣陣，塵土飛揚，驕陽蒙暈。

    巖崎川的西岸，上杉、織田兩軍在這秋風之中不斷搏殺，戰場之上，尸骸交錯，凄涼無邊，鮮血也將巖崎川染成了紅色。

    這時，丹羽氏職在巖崎城三之丸的箭櫓上發現上杉軍已經完全占據了主動，并將織田軍打得節節敗退后，當即下了箭櫓，翻身上馬，在馬廻眾的簇擁下，率三百余軍勢出城馳援友軍。

    只見巖崎丹羽勢在丹羽氏職的率領下，一齊發出吶喊聲，紛紛冒死突進，喊殺聲更是響徹天地，使得上杉軍各部的士氣進一步提升。

    丹羽氏勝、上田近正兄弟二人自恃勇猛，一手持太刀，一手持木楯，一路斬翻諸多織田軍的武士、足輕、農兵。他們身旁的上杉軍是深受感染，也奮力上前助戰。

    隨后，混亂很快就蔓延至尚未敗退的織田軍各部之中。

    飯尾定宗、織田信房、佐久間盛重、佐佐政次等將皆是織田家中的久經沙場之人，知曉大勢已去，再無反轉的可能。在他們眼中，擊潰并不是什么可怕的事情，只要不被討取、殲滅，那么待戰后收攏潰軍，再休整一段時間，就又能恢復元氣了。

    然而，八條定繁可不打算輕易放過這個一舉殲滅織田家有生力量的大好時機。因為，織田家在尾張、美濃、三河、伊勢等國的戰事中多次被擊敗，在收攏潰軍，以及依靠其本就雄厚的財力，又能再度糾集數千至上萬規模的軍勢，故而戰事經久不息。

    八條定繁此時意圖將織田軍潰軍的大部分進行殲滅，就是汲取了這個教訓。于是，他就令長井為實火速率左控鶴備的三百名騎馬武士搶占竹之山、寶林寺兩地，將織田軍潰兵逃往下社城的必經之路截斷。

    才退入寶林寺中不久的織田信張（織田寬廉，織田藤左衛門寬故之子，織田信康女婿，其母為斯波義達之女玉堂殿）、織田常知（織田信張之弟）兄弟還沒喘過一口氣，就發現寺外塵土飛揚，只見上百名騎馬武士正殺氣騰騰的向自己沖來。

    自知無路可逃的織田信張、織田常知兄弟就只好命麾下馬廻眾前去阻擊，他們二人則是退入大殿之中互刺而亡，以免落得個被俘受辱的下場。

    與此同時，八條定繁在率軍擊潰織田信時、織田信實兩部，并將織田信時、織田信實二人討取以后，就與丹羽氏職合兵一處，對織田軍的潰兵進行持續追擊。